五十路熟妇无码AV在线,日本親子亂子倫xxxx50路,国产欧美一区二区精品久久久,一个人看的免费视频大全在线观看,国产伦一区二区三区四区

隨著腫瘤免疫療法的興起，免疫系統(tǒng)在腫瘤研究中的作用受到了極大的關(guān)注。免疫系統(tǒng)的一些組分或其變化，已被用于腫瘤預(yù)后或預(yù)測(cè)腫瘤免疫治療的療效。例如，腫瘤浸潤(rùn)淋巴細(xì)胞的存在被證明與一些癌癥的良好預(yù)后直接相關(guān)^[1]。然而，盡管一些患者存在高豐度的腫瘤浸潤(rùn)性淋巴細(xì)胞，但并不能保證有良好的療效。因此，需要更深入地了解腫瘤組織中免疫細(xì)胞的類型及其激活狀態(tài)、功能和特異性。作為適應(yīng)性免疫的關(guān)鍵細(xì)胞效應(yīng)器，T細(xì)胞的抗原特異性由T細(xì)胞受體（TCR）決定，這意味著TCR庫(kù)（TCR repertoire）可以反應(yīng)人類免疫系統(tǒng)的狀態(tài)^[2]。因此，TCR庫(kù)被認(rèn)為是一種有前景的生物標(biāo)志物，對(duì)TCR庫(kù)的研究有助于表征腫瘤細(xì)胞與宿主適應(yīng)性免疫系統(tǒng)的相互作用，指導(dǎo)如何利用現(xiàn)有或新的治療方法有效地調(diào)節(jié)免疫反應(yīng)，以及如何更好地預(yù)測(cè)腫瘤預(yù)后。

PART 01

在一項(xiàng)研究中，Charles等采用半定量多重PCR方法對(duì)44例I-IV期黑色素瘤患者的外周血和其中7例患者的轉(zhuǎn)移性淋巴結(jié)樣本的TCR庫(kù)多樣性進(jìn)行了研究，并探討其對(duì)臨床預(yù)后的潛在預(yù)測(cè)價(jià)值^[3]。作者使用兩個(gè)參數(shù)對(duì)TCR多樣性進(jìn)行量化：反映V-J重排數(shù)量的多樣性豐富度（diversity richness，DR）和反映種群克隆性的多樣性均勻度（diversity evenness，DE）。作者根據(jù)DR和DE值分析患者的無(wú)進(jìn)展生存期（PFS）和總生存期（OS），發(fā)現(xiàn)患者外周血中較高的TCR庫(kù)多樣性（DR和DE參數(shù)）與較長(zhǎng)的PFS相關(guān)，而多樣性對(duì)患者OS沒有顯著影響（PFS和OS均從采樣時(shí)間開始計(jì)算）（圖1）。作者還進(jìn)一步比較了7例患者血液和淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移瘤中TCR庫(kù)的多樣性（圖2）。盡管總體DR和DE值在血液和腫瘤之間無(wú)顯著差異，但對(duì)個(gè)體進(jìn)行分析發(fā)現(xiàn)，患者1在血液和腫瘤中均具有最低DR值，腫瘤中具有最低DE值，在采樣后疾病進(jìn)展迅速并在采樣四個(gè)月后死亡；相反，具有良好預(yù)后和較長(zhǎng)生存期（接近4年）的患者8在血液和腫瘤中均表現(xiàn)出更高的TCR庫(kù)多樣性。綜上，這項(xiàng)研究表明黑色素瘤患者血液和腫瘤中TCR庫(kù)的多樣性具有潛在的預(yù)后價(jià)值。

圖1  DR和DE參數(shù)的數(shù)值高預(yù)示更長(zhǎng)的PFS^[3]。通過(guò)ImmunTraCkeR?評(píng)估黑色素瘤患者血液中TCR庫(kù)的多樣性，并評(píng)估其對(duì)臨床結(jié)果的影響: (a) 低DR值 (<90%, n="12)和高DR值">90%, n = 32)患者的PFS (左圖)和OS (右圖)對(duì)比; (b) DE值低于或高于中位數(shù)的患者的PFS (左圖)和OS (右圖)的對(duì)比(n = 44)。采用log-rank檢驗(yàn)進(jìn)行分析

圖2  淋巴結(jié)（LN）轉(zhuǎn)移瘤的多樣性可能為臨床結(jié)果提供有用信息^[3]。通過(guò)ImmunTraCkeR^?評(píng)估黑色素瘤患者血液和淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移瘤中TCR庫(kù)的多樣性（計(jì)算多樣性豐富度和均勻度）。血液和淋巴結(jié)DR值(左圖)和DE值(右圖)的對(duì)比

除了黑色素瘤，TCR庫(kù)對(duì)于乳腺癌、宮頸癌、胃癌等惡性腫瘤同樣具有一定預(yù)后價(jià)值（表1）。總的來(lái)說(shuō)，更高的TCR多樣性意味著免疫系統(tǒng)具有更好協(xié)調(diào)抗腫瘤反應(yīng)的能力，所以在健康個(gè)體或疾病進(jìn)展較好的患者中，TCR庫(kù)的多樣性會(huì)更高。

表1  TCR庫(kù)多樣性在腫瘤預(yù)后中的作用^[1]

PART 02

免疫檢查點(diǎn)抑制劑（ICIs）的使用已被證明可以提高多種類型腫瘤患者的生存期。到目前為止，用于預(yù)測(cè)ICIs療效的生物標(biāo)志物主要包括PD-L1表達(dá)、腫瘤突變負(fù)荷（TMB）和腫瘤浸潤(rùn)T細(xì)胞。近年來(lái)，一些研究試圖探索TCR庫(kù)多樣性和克隆性的改變與ICIs治療期間建立的保護(hù)性腫瘤特異性反應(yīng)之間的關(guān)系，主要集中在靶向CTLA-4和PD-1的單克隆抗體這兩類ICIs對(duì)TCR庫(kù)多樣性的影響（表2）^{[1, 4]}。由于難以獲得縱向腫瘤組織樣本，這些研究大多使用循環(huán)T細(xì)胞，少數(shù)使用腫瘤浸潤(rùn)T細(xì)胞。

表2  不同腫瘤研究中ICIs治療后的TCR庫(kù)分析^[1]

在一項(xiàng)試點(diǎn)研究中，Postow等人分析了12例轉(zhuǎn)移性黑色素瘤患者在接受ipilimumab（anti-CTLA-4 antibody）治療前的外周血TCR庫(kù)多樣性，以確定治療前TCR庫(kù)多樣性是否與ipilimumab治療的臨床結(jié)果相關(guān)^[5]。作者通過(guò)豐富度（richness，觀察到的V-J重排）和均勻度（evenness，特定V-J重排頻率之間的相似性）這兩個(gè)參數(shù)來(lái)研究TCR庫(kù)的多樣性。臨床獲益通過(guò)ipilimumab開始治療后腫瘤負(fù)荷減輕或疾病穩(wěn)定時(shí)間延長(zhǎng)至少9個(gè)月的證據(jù)來(lái)確定。結(jié)果顯示（圖3），有無(wú)臨床獲益的患者在TCR庫(kù)豐富度（p = 0.033）和均勻度（p = 0.028）上都存在顯著差異，低豐富度（n = 0/5, p = 0.081）和低均勻度（n = 0/7, p = 0.01）患者均沒有臨床獲益。該研究表明，轉(zhuǎn)移性黑色素瘤患者外周血中基線TCR多樣性與ipilimumab治療的臨床結(jié)果相關(guān)。

圖3  A，有臨床獲益的患者在基線時(shí)TCR庫(kù)的豐富度更高(p = 0.033)；B，有臨床獲益的患者在基線時(shí)TCR庫(kù)的均勻度更高(p = 0.028)^[5]

此外，一些研究發(fā)現(xiàn)抗CTLA-4治療可以增加外周血中TCR庫(kù)的多樣性。例如，為了評(píng)價(jià)tremelimumab阻斷CTLA4對(duì)PBMC的免疫調(diào)節(jié)作用，Robert等人利用NGS評(píng)估了21例轉(zhuǎn)移性黑色素瘤患者在接受tremelimumab治療前、治療30天和60天后，PBMC細(xì)胞中TCR V-beta CDR3的變化^[6]。結(jié)果顯示（圖4），接受tremelimumab治療后，19例患者TCR V-beta CDR3的unique productive sequences中位數(shù)增加了30%，另外2例中位數(shù)下降30%；治療后的豐富度（P < 0.01）和Shannon多樣性指數(shù)（P < 0.04）變化顯著。相比之下，從4名健康人的TCR V-beta CDR3多樣性在1年內(nèi)沒有顯著變化。這項(xiàng)研究說(shuō)明用tremelimumab阻斷CTLA4可以使外周T細(xì)胞庫(kù)多樣化，闡明這類抗體如何調(diào)節(jié)人類的免疫系統(tǒng)。

圖4  Unique productive sequences絕對(duì)數(shù)值的變化^[6]。A，來(lái)自21名黑色素瘤患者(GA，黑色)和4名健康人 (HD，灰色)的基線和tremelimumab治療后樣本之間的變化。B，標(biāo)準(zhǔn)化的TCR V-beta CDR3庫(kù)多樣性。分析比較PBMC樣本的基線和tremelimumab治療后CDR3庫(kù)的變化，這些數(shù)值進(jìn)行歸一化，以可比性的方式顯示治療后的增加和減少

關(guān)于抗PD-(L)-1治療，一些研究也證明了更高的基線外周TCR庫(kù)多樣性與臨床獲益之間的關(guān)聯(lián)。例如，Han等人對(duì)NSCLC患者PD-1+ CD8+ T細(xì)胞的TCRβ CDR3進(jìn)行測(cè)序，以研究其在預(yù)測(cè)NSCLC患者對(duì)抗PD-1/ PD-L1治療反應(yīng)中的作用（圖5）^[7]。兩個(gè)獨(dú)立的隊(duì)列（隊(duì)列A，n = 25；隊(duì)列B，n = 15)分別作為發(fā)現(xiàn)組和驗(yàn)證組。在隊(duì)列A中， ICB治療前PD-1+ CD8+ T細(xì)胞TCR庫(kù)多樣性高的患者對(duì)ICB治療表現(xiàn)出更優(yōu)的臨床響應(yīng)和更長(zhǎng)的PFS（6.4個(gè)月vs 2.5個(gè)月，HR，0.39；95%[CI]，0.17-0.94；P = 0.021）。類似的結(jié)果在隊(duì)列B中也得到了驗(yàn)證，說(shuō)明外周血PD-1+ CD8+ T細(xì)胞中的TCR庫(kù)多樣性可以作為預(yù)測(cè)NSCLC對(duì)ICB治療結(jié)果的生物標(biāo)志物。

圖5  TCR庫(kù)多樣性與PD-1或PD-L1抑制劑治療的反應(yīng)和PFS的相關(guān)性^[7]。A，隊(duì)列A中PD-1/PD- l1抑制劑治療后DC和PD亞組PD-1+ CD8+ TCR多樣性的比較(n = 25)。B，使用ROC曲線隊(duì)列A中區(qū)分PD患者和DC患者(n = 25)。C，隊(duì)列A的PFS通過(guò)PD-1+ CD8+ TCR庫(kù)多樣性進(jìn)行分層(n = 25)。D，隊(duì)列B的PFS通過(guò)PD-1+ CD8+ TCR多樣性進(jìn)行分層 (n = 15)。E，隊(duì)列A的OS通過(guò)PD-1+ CD8+ TCR庫(kù)多樣性進(jìn)行分層 (n = 25)。F，隊(duì)列B的OS通過(guò)PD-1+ CD8+ TCR庫(kù)多樣性進(jìn)行分層(n = 15)。G, TCR多樣性對(duì)判斷PD-1或PD- L1抑制劑的臨床反應(yīng)(DC vs PD)的敏感性和特異性(n = 40;DC, n = 23, PD, n = 17)

然而，Hogan等人在一項(xiàng)研究發(fā)現(xiàn)TCR庫(kù)多樣性與anti-PD-1治療結(jié)果存在負(fù)相關(guān)（圖6）^[8]。在該研究中，作者采用multi-N-plex PCR技術(shù)測(cè)試了接受anti-CTLA4 (n = 42) 或anti-PD1 (n = 38)治療的黑色素瘤患者在治療前PBMC的TCR庫(kù)組合多樣性均勻度（DE50，其數(shù)值越低，代表TCR克隆越多，多樣性越少）。在多變量回歸模型中評(píng)估治療結(jié)果、臨床變量和DE50之間的相關(guān)性，并通過(guò)Fisher精確檢驗(yàn)進(jìn)行驗(yàn)證。結(jié)果顯示，低DE50數(shù)值預(yù)示著患者anti-PD-1治療有良好反應(yīng)和更長(zhǎng)的PFS，但是對(duì)于anti-CTLA-4治療預(yù)示著較差的臨床獲益。不同研究結(jié)果的差異表明，需要更深入的研究，以助于更好地了解其他因素對(duì)TCR庫(kù)變化的影響。

圖6  治療前TCR多樣性的均勻度^[8]。A，散點(diǎn)圖顯示對(duì)anti-CTLA-4治療有反應(yīng)或無(wú)反應(yīng)患者的基線DE50。N = 42。虛線，20.03%。B，散點(diǎn)圖顯示對(duì)anti-PD-1治療有反應(yīng)或無(wú)反應(yīng)患者的基線DE50水平。N = 38。虛線，20.4%。用Fisher精確檢驗(yàn)計(jì)算P值

PART 03

盡管缺乏對(duì)TCR庫(kù)如何影響癌癥發(fā)展的了解，但目前已有明確的證據(jù)表明，TCR庫(kù)在作為預(yù)測(cè)腫瘤進(jìn)展或預(yù)測(cè)ICIs治療效果的生物標(biāo)志物方面具有巨大的潛力。

熙寧|精翰NGS實(shí)驗(yàn)室應(yīng)用基于多重PCR建庫(kù)的免疫組庫(kù)檢測(cè)方法特異性地?cái)U(kuò)增TCR/Ig受體鏈編碼基因（TRB、TRD、TRG，以及IgH、IgL、IgK），檢測(cè)T/B細(xì)胞受體基因的克隆性重排，在時(shí)序樣本檢測(cè)中，通過(guò)檢測(cè)患者體內(nèi)TCR譜系的變化來(lái)評(píng)估治療效果以及跟蹤疾病進(jìn)展或復(fù)發(fā)。本檢測(cè)方法已經(jīng)經(jīng)過(guò)了完善的性能驗(yàn)證，可以供申辦方直接使用。

熙寧|精翰NGS實(shí)驗(yàn)室依據(jù)CAP質(zhì)量的要求，建立了完善的質(zhì)量體系。實(shí)驗(yàn)室擁有NextSeq CN500測(cè)序儀，支持本地測(cè)序，且多次滿分通過(guò)CAP的能力驗(yàn)證。按照質(zhì)量體系的要求，實(shí)驗(yàn)室建立了豐富的檢測(cè)方法，全面支撐藥物的安全性評(píng)估、治療效果評(píng)估、入組篩查和生物標(biāo)志物的探索等，在藥物研發(fā)的各個(gè)環(huán)節(jié)發(fā)揮重要作用：

歡迎后臺(tái)留言咨詢。

參考文獻(xiàn)：

[1] Aran A, Garrigós L, Curigliano G, Cortés J, Martí M. Evaluation of the TCR Repertoire as a Predictive and Prognostic Biomarker in Cancer: Diversity or Clonality? Cancers (Basel). 2022 Mar 31;14(7):1771. doi: 10.3390/cancers14071771. PMID: 35406543; PMCID: PMC8996954.

[2] Porciello N, Franzese O, D'Ambrosio L, Palermo B, Nisticò P. T-cell repertoire diversity: friend or foe for protective antitumor response? J Exp Clin Cancer Res. 2022 Dec 22;41(1):356. doi: 10.1186/s13046-022-02566-0. PMID: 36550555; PMCID: PMC9773533.

[3] Postow MA, Manuel M, Wong P, Yuan J, Dong Z, Liu C, Perez S, Tanneau I, Noel M, Courtier A, Pasqual N, Wolchok JD. Peripheral T cell receptor diversity is associated with clinical outcomes following ipilimumab treatment in metastatic melanoma. J Immunother Cancer. 2015 Jun 16;3:23. doi: 10.1186/s40425-015-0070-4. PMID: 26085931; PMCID: PMC4469400.

[4] Joshi K, Milighetti M, Chain BM. Application of T cell receptor (TCR) repertoire analysis for the advancement of cancer immunotherapy. Curr Opin Immunol. 2022 Feb;74:1-8. doi: 10.1016/j.coi.2021.07.006. Epub 2021 Aug 25. PMID: 34454284.

[5] Postow MA, Manuel M, Wong P, Yuan J, Dong Z, Liu C, Perez S, Tanneau I, Noel M, Courtier A, Pasqual N, Wolchok JD. Peripheral T cell receptor diversity is associated with clinical outcomes following ipilimumab treatment in metastatic melanoma. J Immunother Cancer. 2015 Jun 16;3:23. doi: 10.1186/s40425-015-0070-4. PMID: 26085931; PMCID: PMC4469400.

[6] Robert L, Tsoi J, Wang X, Emerson R, Homet B, Chodon T, Mok S, Huang RR, Cochran AJ, Comin-Anduix B, Koya RC, Graeber TG, Robins H, Ribas A. CTLA4 blockade broadens the peripheral T-cell receptor repertoire. Clin Cancer Res. 2014 May 1;20(9):2424-32. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-13-2648. Epub 2014 Feb 28. Erratum in: Clin Cancer Res. 2015 Jul 15;21(14):3359. PMID: 24583799; PMCID: PMC4008652.

[7] Han J, Duan J, Bai H, Wang Y, Wan R, Wang X, Chen S, Tian Y, Wang D, Fei K, Yao Z, Wang S, Lu Z, Wang Z, Wang J. TCR Repertoire Diversity of Peripheral PD-1+CD8+ T Cells Predicts Clinical Outcomes after Immunotherapy in Patients with Non-Small Cell Lung Cancer. Cancer Immunol Res. 2020 Jan;8(1):146-154. doi: 10.1158/2326-6066.CIR-19-0398. Epub 2019 Nov 12. PMID: 31719056.

[8] Hogan SA, Courtier A, Cheng PF, Jaberg-Bentele NF, Goldinger SM, Manuel M, Perez S, Plantier N, Mouret JF, Nguyen-Kim TDL, Raaijmakers MIG, Kvistborg P, Pasqual N, Haanen JBAG, Dummer R, Levesque MP. Peripheral Blood TCR Repertoire Profiling May Facilitate Patient Stratification for Immunotherapy against Melanoma. Cancer Immunol Res. 2019 Jan;7(1):77-85. doi: 10.1158/2326-6066.CIR-18-0136. Epub 2018 Nov 13. PMID: 30425105.